
(图片来源:CC0 Public Domain)
RNA介导的染色质调控对于许多组织中的基因表达十分关键。但目前尚不清楚RNA是如何调控染色质DNA的包装,从而控制基因的表达开关。
然而,来自Caroline Dean教授实验室Xiaofeng Fang博士的一篇新论文展示了塑造染色质的蛋白和RNA处理机制之间相互作用的过程。由此确立了反义RNA处理如何影响染色质状态,以及定量调控拟南芥FLC位点的表达。
该研究小组使用了一种名为交联核免疫沉淀和质谱(CLNIP–MS)的手段。这种方法由John Innes Center蛋白质组学团队的专家开发。他们利用甲醛来捕捉植物中蛋白质的相互作用,否则这种相互作用会由于作用时间短而无法捕捉。
在论文中,研究人员揭示了反义RNA COOLAIR如何结合3' RNA进行RNA加工的因子。他们展示了3'RNA加工因子和改变染色质结构的蛋白FLD/LD/SD626动态结合的过程,这个复合体从而阻止了基因的表达。
该研究的主要作者Xiaofeng Feng博士解释道:“这项工作对于了解RNA介导的染色质沉默是十分关键的。我们已经可以机械地将RNA加工因子和染色质修饰因子结合起来。”
这些新阐明的物理相互作用导致染色质的改变,从而关闭FLC——一个调节开花的关键基因的表达。如果3'加工因子或染色质修饰因子被移除,这个基因又会重新表达。
有趣的是,这一过程和酵母中基因调控的方式类似,尽管确切的等效机制在酵母中尚不清楚。表观遗传机制的保守性意味着这项工作与了解所有生物体中基因表达的开关有关。
翻译:唐儆
审校:巢栩嘉
引进来源:约翰英纳斯中心(John Innes Centre)









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