文/姬十三
先来讲一个新近获悉的故事。
休·雷霍夫是一位美国风险投资商,四年前,他欣喜地迎来了第三个女儿出世。然而不幸的是,这个孩子患有某种先天性遗传疾病:肌肉无力,关节弯曲。这种病症有些像是“马凡氏症”或“毕耳氏症”,但又不全然一样。显然,他的孩子患的是一种罕见的遗传病,这意味着没有针对这种病的治疗方法——他带着女儿找了很多医生,都不见起色。
故事本该就这样结束,留下一个被疾病折磨的家庭。但是,雷霍夫不是个普通的商人,他从商前曾在约翰霍普金斯大学拿过遗传学博士学位,于是,他打算重新捡起他的生物学知识,揭开藏在女儿身体里的秘密:他咨询了很多专家,与他们共同分析女儿的病情;同时,他还自己花2000美元买来一些简单的设备,检测女儿基因中的某些片段,分析其中的异常情况,以期找到病变原因所在。雷霍夫还建立了一个网站,名为“MyDaughtersDNA.org”,以便与他人分享自己在做这件事时所获得的知识,并为其他类似家庭提供帮助。
这是刊载在2007年10月18日《自然》杂志上的封面故事。我很喜欢这个充满勇气的故事,因为它所讲述的,其实是一个科技时代的冒险故事。想想看,若是这个情节出现在古装剧中,大概会是这样:父亲看到女儿身患绝症,决心带着她遍访名医,他们去了京城,又到了西域、天山,后来在某个小山村遇到了一位隐居的医者,在高人指点下,父亲又历经磨难,采得九种珍稀草药,终于治愈了女儿。
有人说,换了现在也差不多。如果得了难治恶疾,能做的只有到处去求助,东南西北地跑来跑去,医院换了一家又一家,还常常无助到给老军医打电话。
的确,一旦身患重病,普通人能做的,只能是求助于专业机构。分析检测一种罕见的疾病,需要大型设备和足够的专业资历,个人根本无从着手。而如果你患上了独一无二的疾病,医疗机构是不会为你开展单独研究的。
但是,试想一下另外一个领域的情况:1946年第一台电脑问世的时候,那玩意儿重达27吨,若不是最顶尖的工程师,恐怕连靠近仔细看一下的信心都没有。然而现在,电脑早已算不上高深,一些狂热的爱好者不仅对它的构造了如指掌,可以自己组装,还能自己解决电脑出现的很多问题。
不用惊讶,几十年后我们也将这样看待自己的身体。我们中的佼佼者,会像买电脑一样买来廉价的测序仪,在家里为自己的基因测序;我们会在论坛(如果那时还有网络论坛)上详细讨论如何读自己的基因组图谱;一些高手会写下攻略,教导大家怎么在几十亿个碱基对中寻找可能致病的环节,告诉大家基因是如何指导蛋白合成、又是如何影响你的身体的,等等。这些都将成为基因时代的常识。有了这些技术和常识,我们就有可能像DIY电脑一样了解和掌控自己的身体。
迈向基因时代
是的,我们即将进入基因时代。这种论调你恐怕已听出耳茧,心里嘀咕着:早说二十一世纪是生物的世纪,却根本没感到异样嘛。
别急,从电脑发明到个人电脑普及经过了半个世纪,而从个人电脑的出现到现在,却不过短短二十年。所以,一旦相关产品实现了个性化、家庭化,转折点就将到来。
现在,我们要等待的是廉价基因测序技术的实现。
就像十多年前奋力迈进电脑时代一样,你也应该首先了解一下基因时代的入门知识。
人的每个细胞里有23对染色体,一半来自父亲,一半来自母亲,成双成对。这是作为一个细胞的基本条件,所以人类身体里的100万亿个细胞绝大部分都有这样两套基因组。这些染色体上密密麻麻地分布着60亿对核苷酸分子,就像一本厚书里密密麻麻的文字一样。每个核苷酸分子包括四种碱基中的一种(简写为A、C、G、T),这四种碱基的不同排列编码了遗传信息,人类身体的整个秘密就储存在这本厚书上,我们把这本书叫做“基因组”。如果将这本书念给你听,每秒钟一个字,每天念8小时,要用两百多年才能念完。
这本书里不是所有的字都有意义,其中许多字不知所云,而另一些则组成有意义的词,大概有数万个,叫做“基因”。“基因”是这本书的灵魂,就像身体的零部件构造蓝图,决定了如何创造一个身体。人类一代一代将基因传递下去,就像不断复印这本巨书。
现在,人类已经可以阅读基因组这本大书,将里面的每个字都翻译成通用的语言,并在人类中传播共享。这个名为“基因测序”的翻译工程,是1990年开始启动的,即所谓的“人类基因组计划”(HGP)。当时人们的技术手段还不是很成熟,科学家们打算花十五年时间、耗资30亿美元来做这件事。
结果,这项工程在2003年提前完成,从而使测序和分析技术得到了很大的发展,到这时,用30亿美元已经可以把基因组测个几百遍了,测序的速度也越来越快。
尽管如此,大规模的测序工作还是只能在专业的测序中心完成,费用高昂,不是普通人可以尝试的。
个人基因组
因此,在这个世纪刚开始的头几年,人们还不敢想象基因测序可以平民化。但是,事情正在悄然发生变化。
最近,美国国家卫生研究院提供了一项基金,向科学家发起了挑战:计划到2009年,每测定一个人的全部基因组,只需要花费10万美元;而到2014年,这个费用应该降到1000美元。最先实现这一目标的研究小组,就可以得到巨额奖金。
这还不够。2006年,美国加州的“X奖基金会”拨款1000万美元,以刺激基因测序技术的发展。这个非营利的基金会宣布,如果有哪个研究组首先实现在10天之内测完100个人的基因组,就将获得这笔奖金。当然这个难度有点大。
几十家公司和学术机构正在致力于降低测序费用。应用新技术的测序仪在不断推出,例如,2005年3月上市的由美国“454生命科学”公司发明的一种测序机,售价只要50万美元,看上去有点像洗衣机,又有点像超大号的iPod。这台测序机每次可以同时分析数以千计的基因片断,时间大约需要四到五小时。
第一个真正实现个人基因组测序的是詹姆斯·沃森,他是DNA双螺旋结构的发现者之一(他因此曾获得诺贝尔生理或医学奖),也是人类基因组计划的领导者之一。这项工作由“454生命科学”公司于2007年5月完成,总共只用了两年时间,花费不到100万美元。这也是目前能实现的个人基因组测序的最廉价记录。沃森的个人基因组图谱在美国国家卫生研究院的网站上公开发表,供全世界查看,这样,有兴趣的研究者就可以上网查询沃森的基因组图谱,并根据这些数据来推断沃森与遗传有关的表象特征,例如他可能患有什么疾病,等等。
虽然离1000美元测序的要求还有点远,但科学界普遍持乐观态度,认为在十年内,全基因测序的费用将降到1000美元一次,相当于一台家用电脑的价格。如果实现了这一目标,就意味着个人基因组时代的到来,大家都有可能像沃森一样,将自己的基因组图谱放在网上交流——当然,你得注意隐私。
个性化基因分析
测序费用从几百万美元降低到1000美元,也意味着只要你愿意,就有可能获知自己的基因组图谱。但是,值得吗?
我们需要知道独特的基因图谱,是因为每个人的基因组序列都不太一样。虽然人与人之间只有0.1%的差别,但就是这点差别决定了每个人的独特之处,决定了为什么我们的外表、生理情况、健康状况会有那么大的不同。
而且,基因组这本大书并非完美无缺,在复印的时候,它有可能出错,如果拿到你手里的书中某一个“基因词”出了错,且关系重大,你就可能生病。因此,我们得找到自己那本书中出错的词:首先需要把这本书全部翻译出来,与原本作对照,此外,还需要知道这些词的意思。
“基因检测”是一项已经开始流行的技术。光在北京一地,就有大大小小数百家打着“基因检测疾病”招牌的公司,价格从2000元到8000多元一套不等。方法是从你身上采一滴血,通过检测基因中某些特定的点,与一些已知的与疾病相关的基因作比较,通过有目的地寻找重要的“疾病词”,就能得知你未来有可能患什么疾病。
有个很好的例子是苯丙酮尿症的预防。这是一种非常严重的儿童疾病,很难治愈,一般在出生后三到六个月发病,病症表现为患者智力逐渐下降,甚至变成痴呆。但是现在简单了,只要让新生儿在离开医院前做一次遗传疾病检测,看是否有相关的基因异常,如果发现有问题,这个新生儿要注意不能吃含苯丙氨酸和可以转化为苯丙氨酸的食物。如此加以预防后,小孩的智力可以在8岁前恢复到中等程度。
再有,有一个基因叫BRCA,如果你查出来带有这个基因的突变片段,将来就有很大可能患上乳腺癌,得及早预防。又比如,科学家发现,有几个与DNA修复系统有关的基因突变与肠癌相关,如果携带这些基因型的人从25岁开始每3年做一次肠镜检查,40岁开始每年做一次,甚至做一次预防性切除手术,就能使家族性肠癌的发病率下降90%。
现在能检测的疾病易感基因大概有几千种。通常基因检测公司会帮你查常见的几十种,不需要对整个基因组序列进行测序,这样会大大降低成本。
但是,先别想得太美好。人体是一个复杂的工程,对每个人的个体建设史来说,因为受到环境因素的影响,最后的成品不是“唯基因决定”的:有些基因发挥的作用大,有些发挥的作用小,有一些则根本不起作用。你带有某种疾病的易感基因,并不代表这就是致病基因。越注意生活习惯,逃脱疾病魔爪的可能性就越大,但基因检测无法告诉你这种概率是多少。有些妇女在查出BRCA基因突变后,就去做了乳房切除术,很难说她这种做法是对是错。
而且,即便你的检测结果良好,也不可以因此大意。原因有二:一是目前科学家对基因之书还不是很了解,能检测的基因只是小部分;二是许多疾病都不是单一基因决定的,像高血压、哮喘、肥胖症等常见疾病都与多个乃至数百个基因息息相关,而检测却无法做到那么全面。因此,现在的基因检测能告诉你的有用信息还很有限。
功能基因组学
所以,为了配合基因测序技术的发展,科学家还需要尽快解开基因之书的秘密:每个基因是如何指导蛋白质合成的,这些蛋白质又是如何参与身体的构成,如何让一个人行走、思考、繁衍的……这些都是基因这本书的“后传”,科学家需要把这套身体系列丛书统统解码出来,否则,即使人人都搞到了自己的基因组序列也没有大用,因为大多数的基因信息我们都读不懂。
这就是功能基因组学所要解决的问题。2003年,为了纪念DNA双螺旋结构发现50周年,全球600多位顶尖的科学家一起讨论基因组的研究方向,大家提出了许多设想,其中最重要的一个方面,就是要将生命科学和临床医学结合,将人类基因组成果转化应用到临床实践中去。因此,2003年又被称为“基因组医学”的诞生年。
功能基因组的研究,包括蛋白质组、转录组、代谢组、癌基因组、疾病基因组、药物基因组、环境基因组、脑功能组和行为基因组等等,基本上将人类身体的秘密一网打尽。2007年10月18日,《自然》杂志发表论文,宣告由多国科学家合作进行的国际人类基因组单体型图计划(HapMap计划)的二期工作已经完成,这是人类基因组计划完成测序后的又一个国际合作项目,中国也参与了其中10%的工作。这个计划相当于为人类基因贴上一个个标签,完成以后,就可以低成本、高速度地发现致病基因。功能组的研究现在看起来还很复杂,但是,我们不需要等所有研究都完成以后才利用这些成果,当一个个疾病的秘密纷纷被解开时,被这些疾病困扰的患者也将陆陆续续得到解放。
人类身体内的信息极其丰富,将来,我们每个人或许都会拥有自己身体的海量信息,不光是基因组序列信息,还可能包括蛋白质的全部数据、身体和面部的尺寸以及脑成像仪扫描的图像数据,这些信息可能储存在一张光盘(当然,那时很可能用的是别的存储介质)里,终身保存。当你生病的时候,就可以调用这些信息加以分析。而普通爱好者也可以在网上就部分信息互相进行交流,甚至两个相爱的情侣可以对比一下各自的遗传信息,商量将来要一个什么样的孩子。
还不止这些。微软的研发部门正在实施一项新计划,叫做“我的数码生命”(MyLifeBits),目的是发明一种技术来收集与一个人有关的所有信息,包括他遇到的所有人、说过的所有话、看过的所有东西,甚至包括每天的心跳、血压等等健康数据。这相当于是收集一个人生命中的动态信息,而你可以把前面讲到的个人身体信息看作是静态的信息,将这两种信息结合起来,个人的一切都将尽在掌握中。
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