肉鸡和蛋鸡的防疫工作是非常重要的，在鸡场中对于肉鸡和蛋鸡的防疫工作必须制定一个十分严格的免疫程序，对于今后的鸡常见病的预防也是一个重要环节。以下是推荐的肉鸡和蛋鸡的免疫程序。
一、肉鸡免疫程序（包括乌骨鸡、雉、鹌鹑、珍珠鸡）
1日龄：孵化出壳24小时内，马立克疫苗1羽份皮下注射。
4日龄：肾传弱毒苗、传支H120，2倍量饮水或点眼。
7日龄：马立克疫苗1羽份皮下注射（AA鸡、爱维茵、红宝等快速型肉鸡可免）。
8日龄：新城疫Ⅱ系2倍或Ⅳ系苗1.5倍量饮水或滴鼻点眼。
10日龄：预防新城疫用Ⅳ系苗，使用方法：滴鼻或滴眼。新城疫疫区或发病严重鸡场，可将活疫苗与灭活苗同时使用，即用1头份活疫苗滴鼻，同时新城疫油佐剂灭活苗0.2毫升，肌肉注射。
11日龄：IBD中等毒力苗1倍量滴口或1.5倍量饮水。
13日龄：小鸡三联油乳苗（新城疫、法氏囊、传支二价三联苗）每羽皮下注射0.3—0.5毫升。
14日龄：预防传染性支气管炎，用呼吸型、肾型、腺胃型传染性支气管炎油乳剂灭活苗0.3毫升。使用方法：肌肉注射。
17日龄：预防法氏囊炎，用中毒株法氏囊炎疫苗（法倍灵）。使用方法：饮水给予。
20—25日龄：禽霍乱油乳苗每羽皮下注射0.5毫升（快速型鸡可免）。
28日龄：预防新城疫Ⅳ系苗，使用方法：饮水给予。
40—45日龄：新、副、支（新城疫、副粘病毒、传支二价）三联油乳苗每羽皮下注射0.5毫升。
二、蛋鸡免疫程序
1日龄：预防马立克氏病，用马立克氏病双价苗。使用方法：颈部皮下注射0.2毫升。用单价苗或发病严重鸡场，可用2次免疫方法，即在10日龄重复免疫1次，可明显降低发病率。
7日龄：预防新城疫，用Ⅳ系苗。使用方法：滴鼻。
11日龄：预防传染性支气管炎，用传染性支气管炎H120。使用方法：滴口、滴鼻。
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