四川农业大学动物遗传育种研究所九月初在International Journal of Biological Sciences上发表了题为“Repertoire of Porcine MicroRNAs in Adult Ovary and Testis by Deep Sequencing”*的论文，作者利用深度测序技术，深入研究了microRNA在猪成熟卵巢和睾丸中的表达图谱。此项研究由四川农业大学李学伟教授（通讯作者）和李明洲博士（第一作者）领导的课题组与美国休斯顿大学，LC Sciences公司等机构的科研人员合作完成。
microRNA（miRNA）是一大类短小的内源性RNA，已知它们可以在转录后水平上抑制基因表达，并参与了几乎所有的细胞生理过程。miRNA表达水平的变化与许多疾病密切相关。卵巢卵泡发育与睾丸生精功能是复杂而又协调的生理过程，其中大量基因的严密调节表达和相互作用可能会受到这些miRNA的调控。识别和初步表征生殖腺特异表达的miRNA将是透彻了解由miRNA介导的转录后基因调控在哺乳动物生殖过程中所起作用的先决条件。
研究人员利用深度测序技术（Solexa测序），对成熟卵巢和睾丸内的猪miRNA表达谱进行了鉴定，并利用专门开发的生物信息学分析管道对测序数据进行了深入分析。将可信的成熟miRNA同其它种类的小分子RNA进行了区分。通过这种方法，研究人员共检测到582条前体发夹序列（miRNA前体），编码732条成熟miRNA，其中673条为单一序列。统计学分析显示，224条miRNA（占673条的33.28%）在卵巢和睾丸文库之间存在显著差异表达（P < 0.001）。大多数位于X染色体（伴X染色体miRNA）的差异表达miRNA（34条中的24条，占70.59%）在卵巢中的表达较睾丸中显著上调（P < 0.001）。可以预见，伴X染色体miRNA为睾丸优先表达或睾丸特异性表达模式。为了探究伴X染色体miRNA在基因组定位簇之间共表达的可能性，研究人员采用实时荧光定量PCR（q-PCR）技术，考察了在7种常见猪组织中miRNA位点的间隔距离与32个高置信度伴X染色体miRNA共表达模式之间的关系。实验结果显示，邻近的miRNA对常会共同表达，暗示50kb基因组距离内的miRNA通常来源于共同的转录本。
此项研究以伴X染色体miRNA的共表达模式为研究重点，研究了成年猪生殖腺的miRNA转录组特征。该研究成果将会促进有关miRNA在器官特异性的生殖过程所扮演角色的研究。本研究受到了国家转基因生物新品种培育科技重大专项和国家自然科学基金等的资助。
*Mingzhou Li, Yingkai Liu, Tao Wang, et al. (2011) Repertoire of Porcine MicroRNAs in Adult Ovary and Testis by Deep Sequencing. Int. J. Biol. Sci. 7(7):1045-1055.
新闻来源：http://www.ebiotrade.com/newsf/read.asp?page=201198163027751
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