尽管当前有多种方法可用于全面研究蛋白质编码基因的细胞内作用，然而用于系统研究与多种生物学信号通路有关的长链非编码RNAs (lncRNAs)的技术却十分有限。在这篇文章中，来自德国德累斯顿工业大学的研究人员开发了一种结合非编码RNAs敲除和定位分析的技术，称之为c-KLAN。利用这一技术对lncRNAs进行了功能鉴定和定位，并鉴别出了调控小鼠胚胎干细胞类型的转录物。
在真核生物基因组中大量的蛋白质编码和非编码转录物被转录，然而直到近年来后者才获得广泛的科学关注。LncRNAs是一类非蛋白质编码转录物，长度在几百bp到几kb之间。 众所周知其参与了多种生物学过程，例如X-染色体失活、染色质水平的表观遗传学状态调控、胚胎干细胞状态维持、转录调控以及疾病状态调控等。尽管利用标记和成像技术结合功能缺失研究已成功地应用于大量的蛋白质编码基因研究中，却还没有关于长链非编码转录物显像和表型特征鉴定的类似方法被报道。核酸内切酶切割制备的短干扰RNAs （endoribonucleaseprepared short interfering RNAs，esiRNAs）已被证实更加适合于RNAi筛选，因为它们能够有效地敲除靶向转录物，又避免了天然复杂的siRNAs的显著脱靶效应。研究人员认为相同的优势同样适用于沉默lncRNAs。
在这篇文章中，研究人员构建了一个能靶向594种lncRNAs的esiRNA文库，在小鼠细胞中进行了功能缺失筛查。同时，研究人员还改良了esiRNA合成方法，实现了无缝、可再生合成特异性探针检测了细胞中lncRNAs的定位。
新闻来源：http://www.ebiotrade.com/newsf/2012-2/2012228203747986.htm
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