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揭开基因“侦察兵”的神秘面纱

颜宁和邓东在实验室

TALE(dHax3)与DNA复合物的结构示意图

  转基因食物、转基因动物、基因工程药物已经成为我们的生活中重要组成部分。而这些“转基因”的背后,首先需要人们找到特定的基因,才能对基因组进行“改造”。

  但是,基因的数目实在太庞大的,人类身上就有3万多个基因,32亿个碱基对,面对这一天文数字,科学家该如何下手?如果有个“侦察兵”,手持“扫码器”,精准、快速地帮你找到特定基因,科学家的工作就能事半功倍,甚至事半N倍。

  TALE,这个首先从植物病菌中发现的蛋白,就扮演了基因“侦察兵”的角色。但是,对于TALE的具体“长相”,以及它如何准确地“扫描”出特定基因,在2012年之前并不为人所知,很多科学家都致力于该项基础研究。清华大学结构生物中心颜宁教授、施一公教授和美国普度大学朱健康教授合作,解析了TALE蛋白与DNA复合物的高分辨率晶体结构,从而揭开基因“侦察兵”的神秘面纱。美国《科学》杂志于去岁年末评出的2012年度“十大科技进展”中,这一科研成果赫然在引用之列。

  无心插柳之举

  研究TALE,对于颜宁这位主要从事膜蛋白研究的结构生物学家来说,完全是“无心之举”。

  “我的学生邓东他们给了我一个很大的惊喜,现在回头看,真是一件无心插柳柳成荫的事情。毕竟我们不是第一个开始做TALE的,按照这个课题的重要程度,肯定有无数的结构生物学实验室都想做出它,风险很大。就当让他们练练手吧。我记得当时开玩笑地跟他们说,即使你们不能第一个做出来,第二个做出来也能发一篇论文保证自己博士毕业。既然是练手,如果3个月没有任何进展就放弃。”1月4日,颜宁接受科技日报记者采访时,回忆说。

  TALE(转录激活因子样效应蛋白)首次被科学家发现能特异识别DNA是在2000年。2009年,《科学》发表了德国和美国的两个研究组的论文——通过生物化学和生物信息学方法证明TALE蛋白中的两个氨基酸位点与识别DNA之间有着令人惊奇的一一对应关系。自那之后,世界上有不少实验室试图揭开TALE的神秘“面纱”。

  “2009年《科学》上这篇论文一发表,我们就讨论过,觉得TALE这个蛋白太好玩了,但这不是我的主要研究方向,就等着别人出成果了。”颜宁说。

  2010年9月,美国科学院院士、普度大学朱健康教授邀请颜宁与他合作研究TALE特异性识别DNA的分子机制。这位著名的植物生物学家正在探索使用TALE对植物进行基因改造,他太想知道TALE的“长相”了。“他可谓三顾茅庐找我合作,前两次都被我婉拒了。”颜宁说,“首先这不是我的主要研究方向,还有就是,距离2009年论文发表已经一年多了,一定有很多实验室早就开始从事这项研究了,很可能‘第二天’人家的研究成果就发表了。可是当健康第3次和我谈TALE时,我就不好意思再拒绝了。恰好,邓东他们正在做一个特别难的膜蛋白课题,基本上到了快要绝望的地步,我想那就让他们换换脑子,积累点结构生物学和生物化学的知识也好。”

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